RMSF

RMSF（均方根波动）是指在分子动力学模拟中，用于衡量分子结构波动性的指标。它描述了分子体系中各个原子在某一时刻的位移与其平均位置之间的平均偏离程度。通过计算RMSF，可以了解分子体系的稳定性和结构变化情况，反映原子的运动自由度和柔性。RMSF的计算公式涉及每个原子相对于其平均位置的涨落，通常用于生物大分子结构研究和药物设计等领域。