粗粒化模拟

粗粒化模拟是一种将原子或分子系统中的多个粒子或自由度进行合并或简化，以更大的 “粗粒化” 单元来描述系统行为的模拟方法。 本文将重点介绍其基本原理和计算方法： 自由度简化：将原子或分子系统中相对较小的、对整体宏观性质影响较小的自由度进行整合或忽略。 例如，在蛋白质分子模拟中，可以将氨基酸残基视为一个粗粒化单元，而不必详细考虑每个原子的运动，这样可以大大减少系统的自由度，提高模拟效率。