粗颗化模拟

粒化模拟用于研究复杂系统的行为，特别是涉及大量粒子的系统，如蛋白质、聚台物、胶体颗粒等。在粗粒化模拟中，系统的粒子被合并成更大的单元，从而降低了系统的细节级别，使得计算效率更高，并且能够模拟更大尺度和更长时间的过程。

粒化模拟通常采用经验参数或统计机械方法来描述合并后的粒子的相互作用，这些相互作用力可能捕捉了精细粒子模拟中的某些平均行为。相较于原子级别的分子动力学模拟，粗粒化模拟的计算复杂度较低，能够模拟更大尺度和时间范围的现象，例如生物大分子的折叠和组装、聚合物的相分离、胶体颗粒的自组装等。

粗粒化模拟的一个例子是蛋白质粗粒化模拟。在蛋白质粗粒化模拟中，蛋白质的氨基酸被合并成较大的粒子，如一个二面角(dihedral angle)或一个氨基酸残基，从而大大简化了系统。这样一来，大量的氨基酸可以被表示为较少的粒子，从而显著降低了模拟的复杂度。

粗粒化模拟在研究大尽度复杂系统中的行为和动力学过程方面非常有用，特别是当实验数据不足或者系统太复杂难以进行原子级别模拟时。